Do zakresu działania Wydziału Ochrony Infrastruktury Krytycznej należy m.in:
- opracowanie projektu i aktualizowanie Narodowego Programu Ochrony Infrastruktury Krytycznej;
- tworzenie i aktualizowanie kryteriów umożliwiających sporządzenie jednolitego wykazu obiektów, instalacji, urządzeń i usług wchodzących w skład infrastruktury krytycznej z podziałem na systemy;
- sporządzanie i aktualizacja jednolitego wykazu obiektów, instalacji, urządzeń i usług wchodzących w skład infrastruktury krytycznej z podziałem na systemy;
- analizowanie treści planów ochrony infrastruktury krytycznej, przedstawionych przez operatorów do zatwierdzenia dyrektorowi Centrum;
- sporządzanie analiz i prognoz dotyczących krajowej infrastruktury krytycznej, analizowanie rozwiązań międzynarodowych oraz współpraca w tym zakresie z podmiotami krajowymi i zagranicznymi, w tym z ośrodkami naukowymi i badawczymi;
- współpraca w zakresie ochrony infrastruktury krytycznej z ministerstwami, urzędami i odpowiednimi służbami;
- współpraca w zakresie ochrony infrastruktury krytycznej z właścicielami oraz posiadaczami samoistnymi i zależnymi obiektów, instalacji lub urządzeń infrastruktury krytycznej;
- współpraca, jako krajowy punkt kontaktowy, z instytucjami Unii Europejskiej i Organizacji Traktatu Północnoatlantyckiego oraz ich krajami członkowskimi w zakresie ochrony europejskiej infrastruktury krytycznej i infrastruktury krytycznej.